Сохранилось 25 картин и 8 рисунков:
- Извлечение камня глупости (1475–1480)
- Семь смертных грехов и Четыре последние вещи (1475–1480)
- Распятие с донатором (1480–1485)
- Ecce Homo (1480–1485)
- Несение креста (1490–1500)
- Несение креста (1515–1516)
- Святой Иоанн Креститель в пустыне (1504–1505)
- Святой Христофор (1504–1505)
- Святой Иероним за молитвой (ок. 1505)
- Увенчание терновым венцом (1508–1509)
- Увенчание терновым венцом (ок. 1510)
- Блудный сын (ок. 1510)
Фрагменты несохранившихся триптихов Босха
- Корабль дураков (1495-1500)
- Аллегория чревоугодия и любострастия (ок. 1500)
- Смерть скупца (ок. 1500)
- Святой Иоанн на Патмосе (1504-1505)
- Блаженные и проклятые (1504–1505)
- Ад и Потоп (1508–1514)
- Несение креста (1505)
Триптихи Босха
- Воз сена (1500–1502)
- Распятая мученица (1500–1503)
- Сад земных наслаждений (1500–1510)
- Страшный суд (1504)
- Святые отшельники (ок. 1505)
- Искушение святого Антония (1505–1506)
- Поклонение волхвов (ок. 1510)
Графика Босха
- Слышащий лес и зрячее поле (ок. 1500)
- Человек-дерево (1475-1516)
- Гнездо сов (1455-1516)
- Два монстра (1470-1516)
- Черепаха с черепом на панцире и крылатый демон (1470-1516)
- Две ведьмы (ок. 1450-1516)
- Наброски монстров (1465-1516)
- Улей и ведьмы (1455-1516)
- Ведьмы (ок. 1475-1525)
Картины, приписываемые Босху
- Искушение св. Антония (между 1500 и 1525)
- Голова алебардщика (1550-1599)
- Женская голова (ок. 1500)
- Две мужские головы (ок. 1475-1525)
- Святой Иаков и чародей (1550-1575)
- Поклонение младенцу (1550-1599)
- Поклонение волхвов (между 1500 и 1550)
- Ecce Homo(1557-1599)
- Смерть распутницы (1490-1510)
- Брак в Кане (между 1555 и 1600)
- Страшный суд (ок. 1515)
- Фокусник (между 1496 и 1520)
- Концерт (ок. 1561)